关键词：宏基因组学 微生物群落 微生物发酵床 分析方法 

摘要：养猪微生物发酵床分解猪粪、消除恶臭,将猪粪形成生物菌肥,实现了养猪污染的微生物治理和猪粪的资源化利用,微生物起到关键作用。然而,关于发酵床微生物群落的种类、数量、结构等方面系统研究鲜见报道。课题组采用高通量宏基因组学方法,系统地开展了微生物发酵床的微生物组研究,揭示不同空间、不同深度、不同发酵程度、不同垫料组成、不同季节发酵床中的微生物组成及其区系演替规律。本文就相关的宏基因组测序的样本采集、样本处理、测序原理、分析模型、数据统计、结果表述等分析流程和方法进行了归纳,阐明微生物组操作分类单元（OTU）鉴定,物种累积曲线,核心微生物组,种类丰度主成分分析,种类秩-多度曲线,物种组成丰度柱状图、热图、星图等分析的原理与方法,列举微生物组种类复杂度α-多样性分析、β-多样性分析、种类显著性差异LEfSe分析,冗余分析等实例,为深入研究发酵床微生物群落提供了完整的分析思路和范例。

福建农业学报杂志要求:

{1}投稿须基金项目论文，请给出项目的编号或批准文号，本刊将优先采用。

{2}荐稿文责自负。所有作者应对稿件内容和署名无异议，稿件内容不得抄袭或重复发表。编辑部对来稿有权作技术性和文字性修改。

{3}稿件署名作者应为合法著作权人。文责自负，文章内容无违法违规、不涉及保密，署名无争议。

{4}题名应简明、具体、确切，能准确地概括文章的要旨，符合编制题录、索引和检索的有关原则，并有助于选择关键词和分类号。

{5}参考文献：作者根据来稿的情况，可以列出参考文献（不包括注释中已经出现的文献），但本刊一般在所刊发的文章后面不另开列“参考文献”。

注：因版权方要求，不能公开全文，如需全文，请咨询杂志社