分子植物育种杂志

猕猴桃WRKY转录因子家族全基因组鉴定与分析

关键词: 猕猴桃  wrky转录因子  全基因鉴定  生物信息学分析  

本研究旨在鉴定猕猴桃WRKY基因家族成员,为进一步研究Ac WRKY转录因子在猕猴桃生长和发育进程及生物和非生物胁迫中的调控作用提供信息。利用‘红阳’猕猴桃全基因组数据,通过生物信息学在线分析网站与软件利用的方法,对猕猴桃WRKY转录因子家族成员进行鉴定和系统分析。分析表明：从猕猴桃全基因组中共鉴定出89个Ac WRKY基因,分组鉴定和进化分析...

菜豆SBP-box基因家族的分子特征与进化分析

关键词: 菜豆  基因家族  sbp基因  转录因子  

SBP蛋白是植物特有转录因子,参与众多生物学过程。尽管在许多植物中SBP家族基因已经被鉴定,但在菜豆中仍然未见报道。本研究为探索菜豆SBP-box基因家族,基于生物信息学手段充分挖掘菜豆基因组和转录组数据资源,鉴定出23个菜豆SBP基因,并系统分析了这些SBP基因的结构、定位、保守基序、表达和系统进化关系。结果表明：23个基因被分为2个大类群,散...

木薯MePYL8基因克隆及表达分析

关键词: 木薯  pyl家族  基因克隆  表达分析  

脱落酸介导的核心信号通路在植物应答非生物胁迫的过程中具有重要功能,而PYL蛋白是该信号通路中ABA的受体,因此研究PYL家族基因有助于完善对该信号通路的理解。本研究利用PCR技术从木薯栽培种KU50中克隆得到一个PYL家族基因,命名为MePYL8,该基因的开放阅读框全长为579 bp,编码193个氨基酸。对其进行序列比对表明MePYL8与橡胶树和麻疯树中的氨基...

观赏羽衣甘蓝BoMYB114基因编码区的克隆及序列分析

关键词: 羽衣甘蓝  bomyb114  基因克隆  生物信息学  

花青素是羽衣甘蓝叶片呈紫色、红色及粉色的重要色素,R2R3-MYB类蛋白被认为是调控植物花青素生物合成的转录因子。本研究以羽衣甘蓝叶片为试材,采用同源克隆的方法克隆BoMYB114转录因子基因的编码区序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明：BoMYB114基因编码区长度为753 bp,其包含1个完整的开放阅读框ORF,可编码250个氨基酸,预测蛋白的分子量...

醋栗番茄NHX4基因及其启动子序列的克隆与分析

关键词: 醋栗番茄  基因克隆  启动子  生物信息学分析  

本研究在醋栗番茄基因组鸟枪序列的基础上,基于同源序列的保守性,克隆了醋栗番茄液泡膜Na＋/H＋逆向转运蛋白4基因（SpNHX4）的cDNA序列,对其响应盐胁迫的表达模式进行了分析。通过染色体步行法克隆了该基因的启动子区域,并通过生物学软件对该基因编码的蛋白和启动子序列进行分析。结果显示,SpNHX4的c DNA序列包含1 611 bp的开放阅读框,编码536...

百合类胡萝卜素代谢途径关键酶基因的分析及LoLcyB的克隆

关键词: 百合  类胡萝卜素代谢途径  lolcyb  半定量pcr  

本研究以东方百合品种‘Justina’叶片的5个生长阶段（10 d,25 d,50 d,75 d和100 d）和生长100 d的花柱、花药、花瓣、叶片、茎、鳞茎和根这7个不同部位为试验材料,采用有机溶剂法测量百合类胡萝卜素和叶绿素含量,根据转录组文库测序结果对百合类胡萝卜素代谢途径的12个关键酶基因（PSY,PDS,Z-ISO,ZDS,CRTISO,LCYB,LCYE,%HYB,VDE,ZEP,CCS和NCED...

基于转录组学的不同色系蝴蝶兰花色苷差异积累分析

关键词: 蝴蝶兰  不同色系  花色苷  转录组测序  差异表达基因  

蝴蝶兰花色丰富且极具变化,是研究花着色机制的理想材料。本研究利用RNA Sequencing（RNA-Seq）技术比较三种不同色系蝴蝶兰花器官转录组,鉴定蝴蝶兰花色苷合成的相关基因,从转录组水平揭示蝴蝶兰花色苷生物合成的分子调控机制。选取白花蝴蝶兰（PAPW）、红花蝴蝶兰（PAPR）和黄花蝴蝶兰（PAPY）为试验材料,对其花苞及盛开花朵分别釆样,分别提取...

枣WRKY转录因子家族的生物信息学分析

关键词: 枣  wrky  转录因子  生物信息学  

明确枣WRKY转录因子家族生物学特征,为深入研究枣WRKY家族基因的功能提供科学依据。通过DNAMAN6、MEGA5、Mapdarw和MEME Suite 4.12.0等软件对枣WRKY转录因子的数目、基因分类、染色体定位、系统进化关系和保守基序进行了分析。结果表明：枣中包含92个WRKY基因,根据WRKY结构域数量及其锌指结构的特征可将其分为GroupⅠ、GroupⅡ和GroupⅢ,Group...

樱桃bHLH转录因子家族基因鉴定及表达分析

关键词: 花芽休眠  bhlh  低温响应  

低温被认为是诱导‘短柄樱桃’花芽休眠解除的关键因子,而花芽如何响应低温并完成积累仍不清楚。植物bHLH转录因子可以响应低温而调控植物生长发育和非生物胁迫过程。研究小组在‘短柄樱桃’花芽转录组文库中发现了30个具有完整开放阅读框的bHLH类转录因子,但其结构特征和低温诱导表达模式仍不清楚。为此,本研究采用生物信息学方法对30个bHLH转...

毛竹PheWRKY9-1基因序列及相关表达分析

关键词: 毛竹  基因克隆  基因表达  

WRKY转录因子参与植物生长发育和逆境胁迫响应的调节过程。采用PCR方法从毛竹中分离了WRKY家族的一个基因,命名为PheWRKY9-1（ID：PH01000326G0720）基因的序列。PheWRKY9-1的CDS的全长为1 578 bp,含有6个外显子和5个内含子,编码一个525 aa的蛋白,含有WRKYGQK高度保守结构域,推测分子量和等电点分别为54.9 kD和9.65。系统进化树分析表明,PheWRKY...

四种木本油料内参基因筛选及Actin基因时空表达分析

关键词: 四种木本油料  内参基因  实时荧光定量pcr  沙棘果实  actin基因  

以油茶、沙棘、文冠果和油用牡丹的成熟种子为材料,利用实时荧光定量PCR分析了7个内参候选基因GAPDH、Actin、TUB、eEF1α、RPL4、UBQ和e IF4A在四种木本油料中的表达稳定性,并进一步验证了Actin基因在沙棘不同发育期种子和果肉中的表达。结果表明,6个内参候选基因GAPDH、TUB、eEF1α、RPL4、UBQ和e IF4A的表达水平在四种本油料种子间存在明显差异...

蓖麻RcFAH12基因cDNA全长克隆及生物信息学分析

关键词: 蓖麻  fah12基因  race  克隆  

RACE技术是一项扩增基因末端序列的新技术。本研究以蓖麻籽的RNA为模板,以Gen Bank上FAH12基因序列设计特异引物,运用RT-PCR和RACE技术扩增并获得了特异片段。该片段经PCR、酶切和测序验证,证实所克隆序列为蓖麻FAH12的cDNA全长序列。生物信息学分析,此片段包含1 164 bp组成的开放读码框（ORF）,编码387个氨基酸,分子量为44 426.21 Da,p I=8.95...

International Journal of Molecular Medical Science（IJMMS）

关键词: 医药科学  分子  杂志  国际  proteomics  微生物学  疾病治疗  生物化学  

生物信息学手段鉴定和分析蒺藜苜蓿基因组中水孔蛋白基因家族

关键词: 蒺藜苜蓿  水孔蛋白  系统进化  抗逆  

植物水孔蛋白不仅调控水分运输,同时还可以在植物细胞间传递气体如CO2,和营养物质如硼（B）、硅（Si和活性氧（ROS））,是多功能的蛋白质。植物水孔蛋白的功能对于植物生长和非生物胁迫的反应也起到重要的作用。对蒺藜苜蓿基因组序列进行检索和筛选,共鉴定出46个水孔蛋白基因。蒺藜苜蓿水孔蛋白基因大小较为集中均一（绝大多数由200～400个氨基...

白花虎眼万年青QtWOX8基因的克隆及特性分析

关键词: 白花虎眼万年青  叶上珠芽  qtwox8基因  干细胞  器官发育  

Wuschel-related homeobox（WOX）基因是植物特有的同源异型盒转录因子,在调控干细胞活性和器官发育中发挥重要作用,然而在百合科植物等鳞茎球根花卉中中尚未见到报道。本研究首次从百合科植物白花虎眼万年青叶上珠芽中分离出WOX基因家族成员,进行氨基酸保守序列比对及系统进化分析后,将其命名为QtWOX8基因。将其置于UBI启动子下在烟草中超量表...

渐绿木霉基因组中PKS和NRPS基因的多样性分析

关键词: 渐绿木霉  多样性  聚酮合成酶  非核糖体多肽合成酶  

为了探究渐绿木霉（Trichoderma viridescens）基因组中聚酮合成酶（polyketide synthase,PKS）和非核糖体多肽合成酶（non-ribosomal peptide synthase,NRPS）的多样性,为寻找合成生物活性物质的潜在菌株提供科学依据。本研究通过18S rDNA序列分析,鉴定菌株SC-1为渐绿木霉（T.viridescens）;利用兼并性引物对菌株SC-1的PKS和NRPS基因进行PCR扩...

浙江农林大学暨阳学院生命科学研究所

关键词: 生命科学  研究所  ils  浙江  大学  学院  

浙江农林大学暨阳学院生命科学研究所（Institute of Life Science,Jiyang College of Zhejiang A＆F University,ILS）是一个以研究者的学术兴趣驱动,针对与人类命运相关的农业及生物环境问题,开展基础性学术研究的研究所。浙江农林大学暨阳学院生命科学研究所,由诸暨市璜山籍知名乡贤、＂知本科学家＂、著名农业及生物技术专家方宣钧博士倡议.

浙江翠溪文化传播有限公司

关键词: com  ccc  文化  浙江  

浙江翠溪文化传播有限公司（Cuixi Culture Com.Ltd.,Zhejiang,CCC）,是科学与人文艺术的内容生产者和服务提供商,致力于促进科学与人文艺术发展,先进文化理念传播,科技文化知识普及。我们业务涵盖图书出版、期刊编辑、会展广告、文艺创作、作品翻译、创意设计等方面,提供数字化、视频化、网络化的作品、创意和服务。翠溪文化传播有限公司致力于...

Genomics and Applied Biology（GAB）

关键词: 应用程序  生物学  网上出版  生物信息学  基因表达式  杂志  加拿大  图书馆  

International Journal of Horticulture （IJH）

关键词: 园艺  杂志  国际  网上出版  植物病理  植物营养  热带水果  观赏植物  

International Journal of Marine Science （IJMS）

关键词: 海洋学  杂志  科学  国际  网上出版  社会经济  合作管理  生态系统  

Bioscience Methods （BM）

关键词: 生物科学  科学方法  技术修正  网上出版  统计软件  apc  实验室  cad  

International Journal of Clinical Case Reports （IJCCR）

关键词: 临床  杂志  国际  案例  网上出版  大小写  apc  作者  

Bt Research （BT）

关键词: bt  网上出版  生物鉴定  抵抗机制  环境风险  公共政策  有机体  毒素  

Journal of Mosquito Research （JMR）

关键词: 蚊子  杂志  网上出版  蛋白质水平  环境风险  公共政策  生态系统  调查结果  

黄山地区马尾松和黄山松基于SSR标记的基因渐渗研究

关键词: 马尾松  黄山松  ssr引物数量  基因渐渗  

本研究以采自黄山地区海拔350～1 850 m的马尾松群体、黄山松群体及其渐渗群体的416个个体为材料,利用筛选的10对SSR引物研究了群体遗传多样性、遗传结构及群体间的渐渗。结果表明：10对SSR引物检测到的等位基因共37个,各位点等位基因数（A）的范围为2～7个,Shannon指数（I）平均为1.0301;按16组海拔高度来分析,10对SSR引物扩增的平均等位基因数...

转化转录因子HaNAC1基因提高马铃薯的抗逆性

关键词: 马铃薯  根癌农杆菌  hanac1基因  抗逆性  

为提高马铃薯抗逆性,利用农杆菌介导法,将携带目的基因HaNAC1质粒分别导入马铃薯栽培种‘大西洋’、‘费乌瑞它’和‘青薯168’中。对卡那霉素（Kan）抗性转化株系经PCR扩增检测,共得到63个阳性株系。利用Southern blot对随机选取的7个转基因阳性株系进行检测,结果表明HaNAC1均已整合到各转基因株系中。对63个阳性株系进行RT-PCR检测,共有55个株...

瓦氏秋海棠（Begonia wallichiana Lehm.）的遗传转化

关键词: 瓦氏秋海棠  组织培养  遗传转化  

瓦氏秋海棠（Begonia wallichiana Lehm.）由于植株个体小、生长周期短、四季均可开花结实、不易滋生病虫害等优点,是一种潜在的优良模式植物候选材料。以瓦氏秋海棠种子获得无菌苗,取其叶片为外植体,利用叶盘转化法对外植体进行不定芽诱导和植株再生。利用该再生体系将潮霉素HYG（hygromycin）基因和荷花查耳酮合成酶CHS（chalcone synthase）...

芒果多胺氧化酶2（MiPAO2）基因克隆表达分析与沉默和过量表达载体的构建

关键词: 芒果  基因克隆  多胺氧化酶2  基因沉默  过量表达  

本研究以芒果果皮为材料探究多胺（PAs）和多胺氧化酶2（PAO2）对芒果果实抗逆性的作用机理。多胺（PAs）如腐胺（Put）、亚精胺（Spd）、精胺（Spm）是无处不在的聚阳离子,在不同的细胞代谢过程具有广泛的功能。多胺氧化酶2（polyamine oxidase 2,PAO2）是真核生物多胺分解代谢途径中的关键酶。本研究根据转录组测序得到芒果PAO2部分片段信息设...

蓖麻耐盐基因HKT的克隆及表达载体构建

关键词: 蓖麻  高亲和钾离子转运蛋白  基因克隆  生物信息学分析  表达载体  

为挖掘蓖麻耐盐相关基因,以盐生植物蓖麻（Ricinus communis L.）叶片为材料。设计特异性引物,克隆高亲和性钾离子转运蛋白（high-affinity K＋transporter,HKT）耐盐基因,并对其序列进行生物信息学分析。结果表明,该基因全长1 596 bp,编码531个氨基酸,推测分子量为59.74 kD,等电点（pI）为9.32。多重序列比对和系统发育树分析表明该蛋白与木薯...

水稻抗褐飞虱基因Bph14分子标记开发及其育种应用

关键词: 水稻  褐飞虱抗性  bph14基因  分子标记辅助育种  

Bph14基因是第一个克隆的水稻抗褐飞虱主效基因,来自药用野生稻背景的B5品系。本研究通过比对Bph14基因在B5和参考基因组日本晴上核苷酸序列差异,开发了一个功能标记H14,在供体B5和7个受体亲本之间存在明显的多态性,能准确地区分含或者不含抗虫基因Bph14的基因型。利用H14标记对Bph14基因的分离群体进行基因型检测和接虫鉴定,根据标记检测结果与...

基于SSR标记的饲草高粱种质资源遗传多样性分析

关键词: ssr标记  饲草高粱  遗传多样性  聚类分析  

为了研究饲草高粱品种之间的遗传关系,本研究利用109对SSR引物对48个饲草高粱种质资源进行遗传多样性分析。结果表明,109对SSR引物在3%琼脂糖凝胶上共检测出300个等位变异,平均每个位点检测到3.08个等位变异。平均多肽信息量为0.605 6,多态性信息指数变幅为0.268 0～0.901 2。通过聚类分析将48个高粱品种分为2个类群。分类结果和已知系谱的亲源...

番茄Ty-1、Ty-3和Mi基因的多重PCR体系建立及应用

关键词: 番茄  mi  多重pcr  

本研究利用10份番茄材料,筛选出能够鉴定番茄抗黄化曲叶病基因Ty-1的双SNP标记,Ty-3基因的SCAR1标记和抗根结线虫病Mi基因的SCAR2标记。应用以上分子标记构建出同时检测番茄Ty-1、Ty-3和Mi基因的多重PCR体系。结果表明,多重PCR扩增结果与单引物PCR扩增结果一致,使用该体系只需1次PCR反应及琼脂糖凝胶电泳便可快速、准确地对番茄3种基因的基因型...

红芽芋茎尖低温疗法脱毒的RT-PCR检测

关键词: 红芽芋  茎尖  低温疗法  脱毒  

为了了解红芽芋茎尖低温疗法再生苗的脱毒情况,本研究对其进行芋花叶病毒（DsMV）、黄瓜花叶病毒（CMV）和芋羽状斑驳病毒（TFMoV）的RT-PCR检测。大田苗均检出芋花叶病毒（DsMV）和黄瓜花叶病毒（CMV）;对于芋花叶病毒（DsMV）,玻璃化法低温疗法脱毒率为50%,包埋玻璃化法低温疗法脱毒率为100%,包埋脱水法低温疗法脱毒率为50%,小滴玻璃化法低温...

红芽芋低温疗法脱毒苗遗传变异的AFLP检测

关键词: 江西铅山红芽芋  低温疗法  脱毒苗  遗传变异  aflp检测  

为探明红芽芋低温疗法脱毒苗的遗传变异,本研究利用AFLP荧光标记和毛细管电泳分离技术对其进行分析。研究表明,利用10对引物组合对江西铅山红芽芋4种低温疗法脱毒苗和大田苗30个样本进行扩增,扩增后的多态性位点数在49～70范围之内。多态性百分率最低是E36M72,为89.23%,多态性百分率最高是E59M66,为100%;观测等位基因数Na在1.892 3～2.000 0的范...

梨花芽休眠进程中microRNA实时定量PCR内参基因的筛选

关键词: 梨  花芽  mirna  内参基因  

本研究通过分析候选内参基因的表达稳定性,筛选出适合梨花芽休眠进程中microRNA实时荧光定量PCR（qRT-PCR）的内参基因。本研究以休眠不同时期的砂梨花芽为材料,挑选了15个候选内参基因,用qRT-PCR技术检测候选基因在休眠不同时期的表达量,利用geNorm、Norm Finder和Best Keeper软件进行表达稳定性综合分析。研究结果表明,梨花芽休眠不同时期中表...

利用荧光SSR标记构建含笑种质指纹图谱

关键词: 含笑  荧光标记  ssr  指纹图谱  

本研究基于高通量荧光SSR标记基因分型技术构建了16份含笑种质的指纹图谱。13对来自近缘种的SSR标记共检测到102条等位片段,每个位点等位基因数5～11不等,平均为7.8个。观测杂合度（Ho）变化范围为0.125 0～0.562 5,平均为0.365 0;期望杂合度（He）变化范围为0.670 3～0.911 3,平均为0.809 9;多态信息量（PIC）变化范围为0.574 8～0.871 4,平均...

甜瓜单性花相关基因CmACS-7的分子标记开发与应用

关键词: 甜瓜  单性花  

甜瓜（Cucumismelo L.）性型中主要是雄花、两性花同株型（雄全同株,简称两性花）,雌雄异花同株型（单性花）比较少见。甜瓜育种工作中为提高制种效率,往往将母本系转育成单性花。传统方法筛选单性花植株耗时长,占地面积大。根据CmACS-7基因序列设计引物进行PCR扩增,甜瓜9份材料均可获得188 bp的片段。多序列比对发现,材料单性花性状与扩增片段...

基于SSR标记的长柄扁桃种质遗传多样性分析

关键词: 长柄扁桃  ssr  遗传多样性  

利用11对SSR分子标记对长柄扁桃10个野生群体遗传多样性和遗传结构进行分析,11对SSR引物共检测到157个等位基因（Na）,各位点平均等位基因数（Na）和多态性信息含量（PIC）分别为14.27和0.50;物种水平上的Shannon＇s信息指数（I）和期望杂合度（He）分别为1.48和0.49。群体水平上的等位基因（Na）、有效等位基因（Ne）、Shannon＇s信息指数（I）...

两种探针标记试剂盒在橡胶树单染色体FISH验证的效果比较

关键词: 巴西橡胶树  单染色体  探针标记  

以巴西橡胶树‘热研7-33-97’同一条染色体的LA-PCR纯化产物为实验对象,通过两种探针标记试剂盒——罗氏生物素切口平移标记试剂盒和碧云天生物素随机引物标记试剂盒对其进行探针标记,从信号覆盖面积,准确性,杂点多少等方面比较这两种标记探针方法的荧光原位杂交检测效率。结果显示：在这两种标记方法中,罗氏生物素切口平移标记试剂盒比碧云天生...