应用mRNA差异显示技术筛选磁螺菌MSR-1磁小体合成相关基因

宋丹晨 郭瑞雪 徐俊杰 吴纱 李峰 淮北师范大学生命科学学院 安徽淮北235000

关键词:磁小体 差异表达序列 

摘要:为寻找Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1中与磁小体合成相关的基因,实验利用氧气浓度对MSR-1生长的影响,应用mRNA差异显示技术筛选与磁小体合成相关的cDN段,经测序后获得7条差异片段序列。共得到M-1,M-2,…,M-7共7条差异片段,然后进行生物信息学分析。片段M-2和片段M-3推测蛋白质均含有保守结构域MqsR,根据MqsR对生物膜形成有重要调节作用推测此片段可能与磁小体外膜的形成有关。其中M-4推测蛋白质具有保守结构域rpoH2,推测此片段编码的蛋白质可能是识别MSR-1中磁小体合成相关基因起始位点的酶。片段M-5推测的蛋白质具有PPK2超家族和ALDH-SF超家族,推测片段M-5编码蛋白质的功能可能是为磁小体提供能量。片段M-6,M-7编码蛋白质推测功能可能也是为MSR-1合成磁小体提供能量。

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