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基因组学与应用生物学杂志

杂志介绍

基因组学与应用生物学杂志是由广西大学主管,广西大学主办的一本北大期刊。

基因组学与应用生物学杂志创刊于1982,发行周期为月刊,杂志类别为农业类。

  • 阴沟肠杆菌B29菌株脂多糖合成基因(waaL,waaG)缺失突变株的构建及分析

    关键词: 阴沟肠杆菌  脂多糖  waal基因  waag基因  内毒素活性  

    脂多糖(LPS)在革兰氏阴性细菌中的功能作用在不同菌株中已有研究,但尚未有对肠杆菌属LPS结构与功能的报道。本研究试图构建能引起肥胖的阴沟肠杆菌B29菌株waaL和waaG基因的缺失突变株,以了解突变体菌株产生的LPS结构与活性与野生菌株产生的LPS的差异。根据同源重组技术原理,利用广宿主自杀性质粒构建成敲除载体pKNG101△waaL和pKNG101△waaG,...

  • 马氏珠母贝LST8基因cDNA的分子特征及表达分析

    关键词: 马氏珠母贝  lst8  基因克隆  

    LST8(lethal with SEC13 protein 8)是TOR(target of rapamycin)复合物的重要组成成分,在生物生长和发育的调控中发挥重要作用。本研究根据马氏珠母贝转录组数据库中注释为LST8的unigene序列设计引物,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得了马氏珠母贝LST8基因cDNA全长序列(pm-LST8);同时利用荧光定量PCR(Real-time PCR)技术检测了...

  • 利用复合PCR方法同时检测三种转基因水稻

    关键词: 转基因水稻  检测方法标准  复合pcr  

    我国在转基因水稻研究方面处于国际领先地位,但由于研究材料扩散到商品化生产水稻中而引起的贸易纠纷时有发生。加强转基因水稻检测与监管,从源头控制转基因水稻基因扩散对于保障生物安全、促进米制品贸易有重要意义。本研究针对我国当前转基因水稻监管重点,结合已有相关检测方法标准,针对三种不同转基因水稻:抗虫水稻TT51-1、抗病水稻M12、抗...

  • 马铃薯StTOM1和StTOM3双干扰植物双元表达载体的构建及转化验证

    关键词: 马铃薯  sttom1  sttom3  植物双元表达载体  

    病毒病是制约马铃薯生产的重要因素之一。在拟南芥等植物的研究中发现,抑制寄主因子可以显著降低细胞中病毒的累积量,从而缓解病害症状。本研究在获得与拟南芥寄主因子AtTOM1和AtTOM3具有同源性的马铃薯基因StTOM1和StTOM3的基础上,尝试用RNAi方法同时沉默StTOM1和StTOM3。以pUCCRNAi为中间载体,构建同时含StTOM1和StTOM3双基因干扰片段StT1-StT...

  • 嗜水气单胞菌粘附素和外膜蛋白A基因克隆与结构预测

    关键词: 嗜水气单胞菌  粘附素  外膜蛋白  序列分析  三级结构  

    采用PCR方法扩增嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)外膜蛋白相关基因,即粘附素(Aha)、外膜蛋白A(OmpA)基因全长序列,进行DNA测序及生物信息学分析。结果表明:Aha基因长1 314 bp,推导编码355 aa,5~24 aa区域为跨膜螺旋,26~355 aa区域为革兰氏阴性菌孔蛋白结构域(PF00267),Aha蛋白三级结构与模板(PDB:1PHO_A)相似性达28.21%;OmpA...

  • 尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种中Fsr1基因的克隆及生物信息学分析

    关键词: foc4  fsr1  生物信息学分析  

    以尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种为材料,克隆其Fsr1基因的DNA及cDNA全长,并对其进行生物信息学分析。根据镰刀菌中相关基因设计简并引物,结合PCR与RT-PCR技术扩增目的片段,进行氨基酸序列推导后分析。得到结果 FoFsr1基因开放阅读框为2 474 bp,共编码824个氨基酸;FoFsr1基因编码蛋白可能是存在于细胞核中的跨膜亲水蛋白,含有54个蛋白磷酸化位...

  • 桧状青霉原生质体制备和再生的研究

    关键词: 桧状青霉  原生质体制备  原生质体再生  

    本文对桧状青霉H16的原生质体制备和再生的相关影响因子进行了初步的研究。结果表明:于30℃,转速为200 r/min的SDYS培养基中培养了16 h的菌丝,经S1溶液洗涤后,在1 mol/L的NaCl为等渗溶液,采用浓度为10 mg/mL的酶液,酶解温度为35℃,转速为100 r/min的条件下处理1.5 h时原生质体量达到最佳,本实验范围内最高达到6×106个/mL;同时,选取含有25 mmol/...

  • 小鼠抗病毒基因viperin的原核表达及其抗原性探索

    关键词: viperin  原核表达  抗原性  小鼠  

    Viperin是一种由Ⅰ型和Ⅱ型干扰素诱导的宿主蛋白,在进化上高度保守。本研究以小鼠脑组织为原材料,通过RT-PCR扩增得到包括完整open reading frame(ORF)的1 155 bp的viperin基因序列,成功亚克隆并构建了原核表达载体pET-32a-vip,将其转化到大肠杆菌Rosetta中进行原核表达。结果表明:原核表达的重组蛋白viperin主要以包涵体的形式表达,用镍离...

  • 脂质体法构建广西巴马小型猪转基因体细胞及转基因克隆胚的生产

    关键词: 脂质体转染法  转基因  克隆  广西巴马小型猪  

    脂质体法是一种传统的向哺乳动物细胞导入外源基因的方法,然而其转染效率受多种因素影响。本研究将从脂质体和质粒DNA量、转染暴露时间以及混合孵育时间等四方面进行探索,以寻找最佳的转染体系。试验结果表明最佳转染体系为:脂质体1.25μL、DNA 0.7μg、脂质体-DNA混合孵育0 min以及转染暴露6 h。随后我们用优化过的转染体系对新生广西巴马小型猪...

  • 蛋鸡卵巢PRSS23基因CDS序列分析

    关键词: 蛋鸡  prss23  卵泡  序列分析  

    为获得蛋鸡丝氨酸蛋白酶23(PRSS23)的CDS序列并分析其结构域,试验根据NCBI中公布的其它物种PRSS23的mRNA序列,设计了特异性引物,采用RT-PCR技术扩增PRSS23 CDS全序列。BLAST比对发现,与其它物种PRSS23预测序列以及氨基酸序列同源性分别为99%、92%、91%、86%和100%、96%、96%、90%;通过分析该序列的三级结构,发现在第117到362位氨基酸之间含有...

  • 甜瓜EIN3/EILs基因家族全基因组鉴定与进化分析

    关键词: 甜瓜  ein3  eils蛋白  基因家族  进化分析  

    以拟南芥的EIN3/EILs蛋白保守结构域为探针序列,对甜瓜全基因组的蛋白质数据库进行搜索,搜索后获得4个EIN3/EILs蛋白序列。对甜瓜EIN3/EILs基因家族的系统进化、序列相似性、基因结构进行了分析。通过对所有甜瓜的EIN3/EILs基因的表达谱分析得知该基因家族在各组织中均有表达,其中在果实以及愈伤组织中高丰度特异表达,不同基因之间的表达模式差...

  • 松墨天牛幼虫cDNA文库的构建及EST分析

    关键词: 松墨天牛  smart技术  cdna文库  表达序列标签  

    松墨天牛(Monlchamus alternatus Hope)是林业重大害虫。本研究运用SMART技术构建了松墨天牛幼虫cDNA文库,库容量为1.09×10^6,文库滴度为5.45×10^6 pfu/mL,重组率为97.8%,平均插入片段大小约为1 000 bp,构建的文库质量较好。随机选取1 022个克隆进行测序,获得了1 012条表达序列标签(ESTs),序列在GenBank中登录号为JZ143720~JZ144731。EST序...

  • 细基江蓠繁枝变种(Gracilaria tenuistipitata var.Liui)群体遗传多样性的ISSR分析

    关键词: 细基江蓠繁枝变种  群体遗传多样性  issr  

    运用ISSR标记对来自深圳、北海和防城港的三个细基江蓠繁枝变种群体进行遗传多样性检测,筛选出的16条ISSR引物共扩增出111条带,引物平均多态位点比例为54.95%。三个群体的多态位点比例深圳群体最高为23.42%,北海群体最低为4.50%;群体平均多态位点比例为11.12%,平均基因多样性(Hs)为0.051 3,表明细基江蓠繁枝变种群体遗传多样性较低。群体遗传...

  • 刺五加糖基转移酶基因的表达及其对皂苷含量的影响

    关键词: 刺五加  糖基转移酶基因  表达  皂苷  含量  

    为了探明刺五加糖基转移酶基因(glycosyltransferase,GT)的表达特点及其对刺五加总皂苷含量的影响。以GAPDH基因为内参照基因,采用实时定量PCR技术分析了不同产地、不同生长发育时期、不同器官刺五加中GT基因的表达规律及茉莉酸甲酯(MeJA)对其表达的影响。并采用浓硫酸-香草醛比色法测定刺五加总皂苷的含量,利用SPPS17.0软件进行相关性分析...

  • 四种栎树EST-SSR信息分析

    关键词: 蒙古栎  无梗花栎  夏栎  欧洲栓皮栎  

    为开发栎属遗传多样性检测的SSR标记,分析了蒙古栎、无梗花栎、夏栎和欧洲栓皮栎EST-SSR的特点,结果表明蒙古栎的EST中3 209.46 bp有一个SSR,无梗花栎中每6 160.36 bp有一个SSR、夏栎中每5 883.30 bp有一个SSR,欧洲栓皮栎中每6 129.12 bp有一个SSR。蒙古栎、无梗花栎、夏栎和欧洲栓皮栎EST-SSR的平均长度分别为21.65 bp、21.1 bp、20.66 bp和20....

  • 用ITS序列识别牧草种质资源

    关键词: dna条形码  物种鉴别  

    DNA条形码技术能够快速、准确地识别物种,对于开展基础性的分类学研究和应用性的生物多样性研究极为重要。本文以广西畜牧研究所牧草种质资源圃的8个物种共22个品种为材料,进行植物条形码ITS测序。PCR结果显示ITS的扩增成功率达到100%,同源性的分析表明各物种中的ITS序列变异显著,共找到99个可以用来区分物种的变异位点,系统进化树的结果表明利...

  • 利用RAPD和ILP技术筛选橡胶树抗寒分子标记

    关键词: 橡胶树  抗寒性  rapd  ilp  

    利用36个RAPD引物和7对ILP引物分别分析30份抗寒性差异的橡胶树种质DNA的多态性。结果显示7个RAPD引物扩增产物中出现9种多态性片段,回收并测序多态性片段,Blast比对结果表明其中6种片段为未知序列,其余3种片段HbR4PF、HbR6PF和HbR1+4PF分别与烟草冷胁迫cDNA文库差异表达基因、反转录转座子和橡胶树contig1323727序列同源。采用半定量RT-PCR分...

  • 不同保存方法和提取方法对扁桃基因组DNA质量的影响

    关键词: 扁桃  基因组dna  保存方法  提取方法  

    以扁桃(Amygdalus conmmuis L.)幼叶为试材,通过7种保存方法并采用改良2×CTAB法、3×CTAB法和SDS法对其DNA进行提取,用琼脂糖凝胶电泳检测其DNA完整性,分光光度计测其产量和纯度,以探讨不同保存方法和不同提取方法对扁桃DNA提取质量的影响。结果表明,扁桃新鲜幼叶、压干幼叶后在-75℃保存、45℃烘干幼叶后在-75℃保存以及硅胶干燥幼叶后在-75℃...

  • 一种不依赖酶切位点的分子克隆方法

    关键词: 分子克隆  酶切位点  同源片段  pcr  

    本研究介绍一种分子克隆的新方法。该方法要求在PCR引物设计时,目的片段上游引物的5'端和下游引物的5'端各设计约25 bp与目标载体末端同源的序列,或目的载体反向游引物的5'端和正向引物的5'端各设计约25 bp与目标片段同源的序列,以便进行融合PCR,PCR反应扩增目的片段后,与载体进行融合PCR。用DpnⅠ消化原始甲基化模板,然后进行转化和重组子...

  • 基于适合度的普通群体基因型熵的逐代演变规律

    关键词: 普通群体  适合度  自交率  熵  平衡趋势  

    本文在引入"熵"来定量普通群体的基因型的"杂"中,考虑到适合度的差异。把适合度量化为一个具有不同基因型群体产生的下一代达到性成熟的相对比例。推算出兼有自花与异花传粉群体的某世代中活到性成熟的3种基因型所占的比例。通过对多种不同的适合度及自交率的群体的不同世代基因型熵变曲线及平衡趋势分析,发现自交率越高,平衡状态的熵越小,...

  • 禽流感病毒研究概述

    关键词: 禽流感病毒  抗原变异  病毒检测  疫苗  

    禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)可引起禽类的呼吸器官或全身性感染。高致病性禽流感病毒可以直接感染禽类,偶尔也能直接或间接感染人类。禽流感的流行会严重影响畜牧业发展和国际进出口贸易。低致病性禽流感病毒可以经基因突变或基因重配转变成高致病性禽流感病毒。高致病性禽流感病毒是在人群中引发流感的一个潜在危险因素,并会严重...

  • 结直肠癌表观遗传学研究进展

    关键词: 结直肠癌  表观遗传学  甲基化  乙酰化  

    近年来,结直肠癌(colorectal cancer,CRC)成为影响人类健康的常见恶性肿瘤之一。目前对CRC发病机制的研究不仅停留在对核基因组的研究,更多集中在表观遗传学对疾病的影响,如DNA的甲基化、组蛋白乙酰化、基因印迹等对疾病发生发展过程的影响。本文主要讲述了CRC的表观遗传学研究进展,旨在探讨表观遗传学在CRC风险预警和治疗中的潜在作用。

  • 家畜脂肪干细胞研究进展

    关键词: 家畜脂肪干细胞  生物学特性  分化能力  应用前景  

    脂肪组织中含有大量的间充质干细胞,目前对于间充质干细胞的研究主要是关注其基本的生物学特性和临床应用方面。脂肪干细胞因具有与骨髓间充质干细胞相似的生物学特性,且有易获取、安全、可迅速扩增等特点,已成为现有干细胞生物工程研究的最理想来源。利用脂肪干细胞建立大动物模型,以研究人类疾病、异体器官移植、动物疾病治疗和组织修复等方面...

  • 《基因组学与应用生物学》征稿启事

    关键词: 基因组学  生物学  应用  中国农业大学  农业资源  北京大学  研究所  海南省  

    《基因组学与应用生物学》由中国农业大学教授李宁院士任主编,北京大学教授朱玉贤院士和海南省热带农业资源研究所所长方宣钧博士任执行主编。

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