基因组学与应用生物学杂志

基于纳米颗粒光学特性的癌症检测

关键词: 纳米颗粒  光学特性  癌细胞  癌症生物标志物  

这篇综述总结了一些基于纳米颗粒光学特性来检测癌症生物标志物和癌细胞的方法。利用纳米颗粒的癌症诊断技术正在逐渐替代传统技术。尽管仍存在一些缺点,但与传统方法相比,基于纳米颗粒的传感器在生物标记检测或癌细胞检测应用中还是有很多优势。这项先进的技术在即时癌症诊断中将非常有用,并且成本低廉,非常有希望成为人性化检测平台的一部分。

Rice Genomics and Genetics(RGG)

关键词: genomics  genetics  committed  innovative  publishing  breeding  submission  discount  http  

NSCLC分类及生存分析预测的全基因组特征基因识别

关键词: 非小细胞肺癌  基因表达数据  基因甲基化数据  模式识别  生存分析  

基于NSCLC(非小细胞肺癌)子类分类在临床和生物医学研究方面的意义,利用全基因组基因表达水平(GE)和甲基化(ME)水平的微阵列数据对NSCLC子类分类进行全基因组特征基因识别分析。针对全基因组微阵列数据的高噪声、超高维小样本特性,利用弹性正交贝叶斯算法对全基因组基因进行递归筛选,识别分类精度最优的特征基因集。以TCGA的490的基因表达数据和...

青海大骨节病区小麦内生镰刀菌和硒对兔膝软骨细胞的影响

关键词: 硒  镰刀菌  大骨节病  蛋白聚糖  软骨细胞  

小麦内生镰刀菌5-5-1菌株是从青海大骨节病区穗期小麦籽粒中分离的一株优势内生镰刀菌,本试验通过采用干重法测定菌丝体生长量;MTT(methylthiazolyldiphenyl-tetrazoliumbromide)法检测软骨细胞存活率;甲苯胺蓝染色法和免疫组化染色法分别检测兔膝软骨细胞内蛋白聚糖(aggrecan)和Ⅱ型胶原蛋白(collagenⅡ)的表达;逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)...

Journal of Mosquito Research(JMR)

关键词: publishing  affecting  innovative  charges  http  qualified  discount  worthy  income  necessarily  

东北地区戊型肝炎病毒基因特征分析

关键词: 戊型肝炎病毒  基因型  同源性  

为探索东北地区戊型肝炎病毒(HEV)流行背景和特征,本实验用抗-HEV抗体酶联免疫试剂盒检测了不同样品血清中的抗体;对样品用RT-PCR检测HEV RNA,对PCR阳性产物进行克隆测序,然后对序列进行分析。对49个呈RNA阳性的样品进行了序列测定,结果显示HEV分离株之间核苷酸同源性为82.2%~100.0%;同时,还与其它四种基因型戊型肝炎病毒进行了核苷酸序列同源性...

Tree Genetics and Molecular Breeding(TGMB)

关键词: genetics  committed  innovative  ornamental  breeding  publishing  outstanding  submission  biochemistry  

缺氧复氧诱导自噬基因表达对滋养细胞生长的影响与机制

关键词: 细胞自噬  细胞增殖  子痫前期  基因表达  

抗血栓苏云金芽孢杆菌的筛选及抗血栓机理的初步分析

关键词: 抗血栓  苏云金芽孢杆菌  筛选  鉴定  抗血栓机理  分析  

我们利用VY/4平板法和酪蛋白平板法从水样、土样和朽木样品中筛选出6株可产生抗血栓活性物质的可滑动的细菌菌株,重点研究了菌株B4和B8,利用萃取法及(NH4)2SO4沉淀法对菌株B4和B8的胞外活性蛋白进行了初步分离。一方面,我们利用纤维蛋白平板法及加热的纤维蛋白平板法检测到菌株B4和B8的胞外蛋白可以通过直接降解纤维蛋白的方式溶解血栓,利用纤维...

乙型肝炎病毒基因组简单结构和完整功能的启示

关键词: 乙型肝炎病毒  基因组  表达和沉默  细胞分化  

众所周知,每一个生命体的生物学性状都由其基因组中基因的表达和沉默有关。乙型肝炎病毒是基因组结构最简单的生命体,其基因组全长仅3.2 Kb,简单的结构却包含了该生命体所有的遗传信息,维持了其全部的生物学功能。乙肝病毒这种结构简单但功能完整的生命体,其细胞内基因表达和沉默的机制却十分精准,理解这种机制为我们研究复杂基因组的基因表达、...

加强表达6-磷酸果糖激酶提高Bacillus subtilis乙偶姻合成效率

关键词: 乙偶姻  枯草芽孢杆菌  代谢工程  丙酮酸激酶  

乙偶姻是枯草芽孢杆菌的主要胞外产物,它是一种广泛使用的食用香精,同时也可作为重要的化学中间体,因此提高枯草芽孢杆菌乙偶姻的产量和生产效率有重要意义。本研究克隆了编码枯草芽孢杆菌6-磷酸果糖激酶(PFKA)和丙酮酸激酶(PK)的编码基因pfk A和py K,并分别将其在高产乙偶姻的枯草芽孢杆菌BM(敲除了2,3-丁二醇脱氢酶的编码基因bdh A)中过量表达...

广西巴马小型猪miR-423-5p基因慢病毒载体构建和鉴定及其在骨骼肌中的表达

关键词: 广西巴马小型猪  骨骼肌  mi  慢病毒载体  

本试验的目的在于检测广西巴马小型猪骨骼肌中mi R-423-5p基因的表达情况及构建p LV-mi R-423-5p慢病毒载体并在C2C12细胞中进行验证。通过q RT-PCR方法检测背最长肌中mi R-423-5p的表达,设计特异性引物对mi R-423-5p基因的前体序列进行扩增并定向克隆到慢病毒载体p LV-CMV-mcs-3xflag-EF1-GFP(p LV)上,鉴定正确的重组质粒用脂质体转染法转染进C...

International Journal of Clinical Case Reports(IJCCR)

关键词: letters  observing  treating  outstanding  submission  advance  qualified  considering  discount  http  

广西巴马小型猪MCP-1、MMP-9基因启动子区SNP位点与动脉粥样硬化相关血清指标的关联分析

关键词: 广西巴马小型猪  snp  动脉粥样硬化  

Bioscience Methods(BM)

关键词: bioscience  bm  letters  submission  outstanding  charges  discount  http  income  qualified  

哺乳动物FoxL2基因的分子进化分析

关键词: foxl2基因  哺乳动物  分子进化  

本研究以FoxL2基因为研究对象,选取Gen Bank公布的26个物种的FoxL2基因氨基酸序列,代表脊椎动物中5纲15目21科24属,重点分析哺乳动物中该基因的结构与功能相关性以及其系统发育情况。结果表明:26条FoxL2基因序列存在非常保守的forkhead结构域,哺乳类比非哺乳动物多出丙氨酸、甘氨酸及脯氨酸重复区,其中多聚丙氨酸束的缩短可能与Ⅰ型BPES相关,而...

家兔UCP3基因SNP多态性及生物信息学分析

关键词: 新西兰兔  加利福尼亚兔  基因多态性  比利时兔  

以比利时兔、加利福尼亚兔和新西兰兔为实验对象构建其DNA池,直接测序筛选SNP位点,结果在兔UCP3基因中筛选到5个多态性位点:intron4-C1298T、exon6-G208A、exon6-G281A、exon6-T303C和exon6-G443A。其中exon6-G208A、exon6-G281A和exon6-G443A为错义突变,exon6-T303C为同义突变,而exon6-G208A导致编码的精氨酸(Arg)变为丝氨酸(Ser),exon6-G281A...

多刺蚁属线粒体细胞色素b序列变异及系统发育关系分析

关键词: 多刺蚁  线粒体  细胞色素b  dna序列  氨基酸序列  系统发育  

多刺蚁属18种昆虫线粒体细胞色素b基因都显示出高A+T含量,达到65.11%~73.66%,表现出很强的A/T碱基偏好性。针对748 bp的基因核苷酸多序列比对显示细胞色素b基因之间同源性高,碱基之间无插入或缺失突变,序列变异形式主要表现为替换。对细胞色素b蛋白的部分序列(133~143个氨基酸)进行比对,结果显示完全无变异的氨基酸有34个,占总氨基酸数目的 23.7...

日粮蛋白质水平对贵州省梅花鹿鹿茸生长的影响

关键词: 梅花鹿  生茸期  蛋白质  产量  品质  

《基因组学与应用生物学》征订启事

关键词: 应用生物学  基因组学  征订启事  分子细胞遗传学  原始研究  发酵工程  生物技术  基础研究  英国国际农业  中国期刊方阵  

小鼠可溶性PD-1蛋白疫苗的设计及不同免疫方式的效果研究

关键词: 白喉毒素  融合蛋白  免疫原性  

PD-1是参与免疫抑制调节、肿瘤免疫逃逸的重要因子之一。通过抑制PD-1,可以提高T细胞的活性、细胞因子的分泌水平,从而提高抗肿瘤效果。本研究通过基因重组,构建了小鼠PD-1胞外结构域蛋白m PD-1和m PD-1与喉毒素跨膜结构域(DTT)融合的DTT-m PD-1蛋白。蛋白经大肠杆菌表达后,由镍柱亲和纯化。用蛋白疫苗免疫Balb/c小鼠后发现,DTT-m PD-1蛋白没有...

International Journal of Molecular Medical Science(IJMMS)

关键词: correspondence  committed  innovative  independently  biochemistry  genomics  chosen  http  vaccines  proteomics  

黄连水煎液对小鼠脑缺血再灌注损伤的保护作用

关键词: 黄连  脑缺血再灌注  sod  mda  保护作用  

为了探究黄连水煎液对小鼠脑组织急性缺血再灌注损伤的保护作用,我们将50只小鼠随机分为5组分别是:假手术对照组、模型对照组(用玻璃分针分离两侧颈总动脉和迷走神经,结扎法同时结扎颈总动脉,造成小鼠急性脑组织缺血再灌注损伤)、黄连水煎液治疗组(25 mg/m L,50 mg/m L,100 mg/m L)。各治疗组分别灌胃给予上述浓度黄连水煎液,模型对照组和假手术...

nptⅡ基因真菌表达载体的构建及在苹果炭疽叶枯病菌遗传转化中的应用

关键词: 炭疽病  新霉素磷酸转移酶基因  农杆菌  启动子  

本研究旨在构建1个适用于苹果炭疽叶枯病菌(Glomerella cingulata)的遗传转化载体,为系统研究该病原菌基因的功能提供便利。通过基因工程及分子生物学技术,将三磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)基因启动子Pgap和新霉素磷酸转移酶基因(nptⅡ)连结于质粒p Cambia0380中。构建的载体p Gapneo R1导入根癌农杆菌LBA4404后,通过农杆菌介导的转化技术(ATMT),成...

Bt Research(BT)

关键词: publishing  affecting  insecticidal  http  commerce  transgenic  canada  crops  

基于16SrRNA测序研究蒙桑根际细菌多样性

关键词: 蒙桑  根际细菌  16s  rrna  多样性  

根际细菌丰富多样,对植物的生长发育有重要影响。为更好的了解野生蒙桑和移植栽培蒙桑根际细菌的多样性组成和差异,本研究提取了两样本的宏基因组DNA,利用Roche 454 GS FLX测序技术对样本菌群的16S r RNA基因的V1~V3区域进行测序。测序结果表明:野生蒙桑根际细菌的主导类群为变形菌门(31.62%)和酸酐菌门(19.8%);栽培蒙桑的主导类群为厚壁菌门(89...

DAS-ELISA法快速检测食品中副溶血弧菌TDH毒素

关键词: 副溶血弧菌  tdh毒素  多克隆抗体  效价  

建立副溶血弧菌TDH毒素DAS-ELISA快速检测法,并运用于食品样品实际检测。以TDH+副溶血弧菌菌体及其TDH毒素制备免疫原,分别免疫新西兰大白兔和BALB/c小鼠,制备兔抗副溶血性弧菌多克隆抗体和鼠抗TDH毒素多克隆抗体,以鼠抗TDH毒素多克隆抗体为捕获抗体,兔抗副溶血弧菌多克隆抗体为检测抗体,建立DAS-ELISA检测法。采用间接ELISA法测定抗体效价,采用...

1株兼有烟碱降解活性解磷菌的分离鉴定

关键词: 解磷菌  烟碱降解  分离  鉴定  

从烟草(Nicotiana tabacum L.)根际土壤中分离到1株兼有烟碱降解活性的解磷菌株,编号为YF24;菌株YF24经过48 h发酵后,培养基上清液中游离态磷含量达到141.6μg/m L,烟碱降解率达到77%,确定YF24具有解磷和烟碱降解的双重活性;对菌株YF24生长特性的研究表明,其最适生长温度是30~35℃,最适p H值范围是5.5~7.0,耐盐性差。通过形态特征观察、生理生化...

巴西橡胶树HbPEPRK1的克隆和表达分析

关键词: 巴西橡胶树  hbpeprk1  基因表达  乙烯利  

根据先前获得的EST序列,从巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)中克隆了一个编码磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶激酶相关激酶(phosphoenolpyruvate carboxylase kinase-related kinase,PEPRK)的基因HbPEPRK1。HbPEPRK1编码区c DNA长度为1 401 bp,编码466个氨基酸。HbPEPRK1蛋白具有典型的的丝/苏蛋白激酶结构特征的结构特征,和其他植物中的类似蛋白具有很高...

International Journal of Horticulture(IJH)

关键词: biotechnology  agronomic  breeding  letters  nutrition  harvest  outstanding  pathology  cabi  physiology  

大豆再生相关基因GmARF的生物信息学及表达分析

关键词: gmarf  大豆  再生  生物信息学  

生长素响应因子(auxin response factor,ARF)在植物生长和发育中起到了非常关键的作用。本研究利用实验室前期转录组测序技术得到的差异表达基因Gm ARF,并应用PLACE数据库、Interpro、expasy数据库、SOPMA、Phyre、Protscale、MEGA5等工具对该基因的启动子元件、编码氨基酸的功能、亲水性、等电点、二级结构、三级结构、同源进化树及KEGG通路进...

葡萄TCP基因家族全基因组鉴定和分析

关键词: 葡萄  tcp基因家族  全基因组鉴定  进化分析  

TCP基因家族是植物特有的转录因子家族之一,在植物的生长、发育等多个过程发挥重要的调控作用。本研究利用生物信息学方法对葡萄TCP基因家族成员、染色体定位、基因分类、进化分析、保守域结构和基因结构进行了详细分析。结果表明,葡萄TCP基因家族含有15个成员;进化分析表明,TCP基因家族可分为2组:ClassⅠ和ClassⅡ,其中ClassⅡ可继续分为CIN和C...

芝麻RSAP-PCR反应体系的正交优化与验证

关键词: 芝麻  rsap  正交优化  体系验证  

限制性位点扩增多态性(RSAP)是一种新型分子标记技术。为获得适用于芝麻的RSAP-PCR的反应体系,本研究通过L16(45)正交设计与单因素试验相结合的方法,对PCR反应体系中模板DNA、Mg2+、d NTPs、引物和Taq DNA聚合酶等影响因素进行了试验优化。结果表明,芝麻RSAP-PCR的最佳反应体系为:在15μL反应体系中,30 ng模板DNA、2.0 mmol/L的Mg2+、0.3 mmol/L...

异淀粉酶在α-环糊精制备中的应用及条件优化

关键词: 木薯淀粉  异淀粉酶  酶转化  

环糊精具有外侧亲水内部空腔疏水的桶形结构,可与众多的各类大小、形状合适的疏水性客体分子形成包合物,改变其理化性质。其中,α-环糊精(α-CD)具有较小的空腔、溶解性好及耐酸解,因此在很多领域具有特殊的应用。目前,单独采用环糊精葡萄糖基转移酶(α-CGTase)生产α-CD的底物利用率低,而已开发的双酶法不仅底物成本高,而且环糊精总转化率及α-CD比...

喷施2,4-表油菜素内酯(EBR)提高棉花抗旱生理响应性的研究

关键词: 棉花  2  干旱胁迫  渗透胁迫  氧化胁迫  

植物激素油菜素内酯能够提高植物的抗旱性。本研究通过PEG6000模拟干旱胁迫,探讨在干旱胁迫下喷施2,4-表油菜素内酯(EBR),对棉花成苗渗透胁迫、氧化胁迫的影响。结果表明,棉花成苗喷施0.5 mg/LEBR后,ASA、GSH含量、叶绿素a、b、a+b含量、可溶性蛋白、甜菜碱及脯氨酸含量显著提高,SOD、POD、CAT的酶活性提高;而渗透势、相对电导率、MDA、O2-、H2O...

生长温度对不同生育期烟草蔗糖代谢的影响

关键词: 烟草  温度  不同时期  蔗糖代谢  基因表达  

为了解不同时期生长温度对烟草蔗糖代谢的影响,以云烟87为材料,通过人工气候室模拟云南江川、贵州遵义和河南襄县的气温条件,在烟草移栽-团棵、团棵-现蕾及成熟期进行温度处理,研究了不同生长温度对烟草可溶性糖、还原糖、蔗糖含量、代谢相关酶活性及相关基因表达的影响。结果表明,随着烟株不断生长,烟草体内可溶性糖、还原糖、蔗糖含量不断增多...

施氮水平对不同烤烟品种氯吸收利用的影响

关键词: 烤烟  品种  氮  氯  

本研究采用田间小区试验,研究了烤烟品种K326、云烟87在不同的施氮水平下对氯吸收利用的影响。研究结果表明,K326和云烟87两个烤烟品种烟叶中的氯离子含量均为下部叶>上部叶>中部叶;且烟叶中氯离子的含量随施氮水平增加而显著降低,与5 g.N/株处理相比,9 g.N/株处理时,K326品种上部叶、中部叶和下部叶中氯含量分别降低了27%、34%、40%,云烟87品种...

干旱胁迫下壳聚糖浸种对小麦萌发期保护酶活性的影响

关键词: 小麦  干旱胁迫  壳聚糖  超氧化物歧化酶  过氧化物酶  过氧化氢酶  

以小麦品种皖麦50为材料,用10%聚乙二醇(PEG6000)模拟干旱胁迫环境,研究了不同浓度壳聚糖浸种对干旱胁迫下小麦萌发期SOD、POD、CAT活性的影响。结果表明,小麦萌发期SOD活性呈先升高后下降的趋势,POD、CAT活性呈逐渐升高的趋势;不同浓度的壳聚糖浸种处理均提高了SOD、POD、CAT活性,以0.6%和0.8%浓度的壳聚糖处理组高于其它组SOD、POD、CAT活性,...

一种适合PCR反应的产黄青霉基因组简易提取方法

关键词: 产黄青霉  酶解法  基因组dna提取  pcr  

为同时高效地对大量产黄青霉(Penicillium chrysogenum)突变株进行分子鉴定,本实验探索了一种适合PCR反应的简易产黄青霉基因组提取方法。该方法首先将产黄青霉菌丝转移至0.7 mol/L Na Cl为等渗剂的蜗牛酶(6 mg/m L)和纤维素酶(4 000 U/m L)酶解液中,超声波处理10 min,然后于28℃酶解14 h,最后95℃加热处理10 min。结果表明,应用该方法获得的裂...

陕西化龙山国家自然保护区鱼类多样性分析

关键词: 化龙山  鱼类资源  多样性  

2011~2012年,对化龙山国家级自然保护区内南江河、岚河干支流的鱼类资源进行了考察,共捕获鱼类1 196尾,鉴定出鱼类27种,分属4目9科23属。鲤科鱼类12种;鳅科6种,分别占种数的44.44%和22.22%。并利用Simpson多样性指数(D)、Shannon-wiener多样性指数(H’)、Brillouin指数(H)、均匀度指数(J’)和Mclntosh指数(DMC)五种分析方法,对本保护区鱼类多样...