利用16S rDNA序列分析鉴定一株产抗菌物质的微生物菌株

别小妹; 陆兆新; 房耀维; 曾泉; 吕凤霞; 袁勇军 南京农业大学食品科技学院; 江苏南京210095

关键词:抗菌物质 16srdna 枯草芽孢杆菌 系统发育分析 鉴定 

摘要:从桃子上分离纯化得到1株产抗菌物质的菌株,命名为fmb3菌,通过抑菌实验发现该菌对革兰氏阳性菌蜡样芽孢杆菌、革兰氏阴性菌大肠埃希菌和真菌扩展青霉等3种常见食品病原菌具有显著的抑菌效果.利用16SrDNA分析对该菌作了系统进化鉴定,首先提取fmb3菌基因组DNA,根据不同种属的细菌的16S rDNA序列两端的保守性设计通用引物,对fmb3菌16S rDN断进行PCR扩增,对扩增得到的目标片段测序,并且利用NCBIBLAST对测序结果进行比对,构建系统进化树进行分析,初步确定该菌属于枯草芽孢杆菌.

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