词袋模型在蛋白质亚细胞定位预测中的应用

赵南; 张梁; 薛卫; 王雄飞; 任守纲 南京农业大学信息科学技术学院; 江苏南京210095; 江南大学粮食发酵工艺与技术国家工程实验室; 江苏无锡214122

关键词:词袋模型 支持向量机 亚细胞定位预测 

摘要:运用词袋模型结合传统的蛋白质特征提取算法提取蛋白质序列特征,采用K-means算法构建字典,计算获得蛋白质序列的词袋特征,最终将提取的特征值送入SVM多类分类器,对数据集中蛋白质的亚细胞位置进行预测,在一定程度上提高了亚细胞定位预测的准确率。

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