关键词：蜘蛛兰 番茄斑萎病毒属 朱顶红褪绿环斑病毒 突变 重组 

摘要：朱顶红褪绿环斑病毒（Hippeastrum chlorotic ringspot virus，HCRV）是2013年首次发现并报道的番茄斑萎病毒属（Tospovirus）的新种，该病毒可引起蜘蛛兰产生同心环纹、叶片畸形、坏死斑等症状。本研究从云南省不同地区选出6份HCRV单独侵染的蜘蛛兰样本，通过RT-PCR、克隆、转化、测序和拼接，获得6份样本的HCRV分离物RNAS序列。6个分离物S序列长度在2714～2747nt之间，其上编码的非结构蛋白NSs（Nonstructural protein by the SRNA）的NSs基因是1332nt，编码N（Nucleocapsid）蛋白的N基因是825nt。通过生物信息学分析，确定了不同HCRV株系间的关系。同时对SRNA序列及其所编码的非结构蛋白NSs及核壳体蛋白N进行突变和重组分析，确定这6个HCRV分离物的RNAS序列均存在突变和重组事件。结合6个分离物采集地的环境信息，可以看出气候类型、温度等环境差异很大，因此推测云南省多样的气候类型跟HCRV在云南省的广泛分布有关，在这6个HCRV分离物中检测到的快速突变和重组可能是导致HCRV快速适应不同环境，分布范围广泛的原因之一。最后，通过系统进化分析，推测采集自云南省保山市的HLS—TCRH是6个HCRV分离物中最先开始进化的，由它分为两个进化支，一支包括玉溪的YN—YX—HT-1和德宏瑞丽的HLS—YNRL-1，另一支包括昆明的HLS—YL，红河的HLS—HHXY以及临沧的HLS—LC—YLHW。

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