甲基化状态风险分析对胶质母细胞瘤患者预后评价意义

康恩铭; 章薇; 章翔 空军军医大学西京医院神经外科; 陕西西安710032

关键词:胶质母细胞瘤 dna甲基化 基因芯片 预后分析 

摘要:目的 胶质母细胞瘤(GBM)的胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(Cp G)岛岸区(GCI shores)甲基化改变较Cp G岛甲基化改变频率更高,但是其与GBM的关系目前尚不清楚。方法 利用肿瘤与癌症基因图谱计划(TCGA),基因表达公共数据库(GEO)中GSE36278和GSE60274系列中的GBM病例资料和芯片数据,通过Cox回归模型与生存分析,研究GCI shores甲基化状态与GBM患者预后的关系。结果TCGA病例组(n=136)中高风险组的中位OS为8.1个月[95%可信区间(CI):5.8-10.5个月],短于低风险组的中位OS为20.1个月(95%CI:17.4-22.8个月),P〈0.001;GSE36278病例组(n=37)中高风险组的中位OS为12个月(95%CI:11.5-12.5个月),短于低风险组的中位OS 15个月(95%CI:12.4-17.6个月),P=0.023;验证组GSE60274病例组(n=62)中高风险组的中位OS为10.5个月(95%CI:7.8-13.1个月),短于低风险组的中位OS 16.0个月(95%CI:14.3-17.7个月),P=0.003;多因素Cox回归分析表明7-GCI shores甲基化状态评分是独立于O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化状态和年龄的预后因素。结论 本研究首次建立并验证了可以预测GBM患者临床预后的基于7-GCI shores区域甲基化状态的风险评分方程。

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